부가세 부과 처분 취소 소송: 사실과 다른 세금계산서 여부

각 세금계산서는 원고가 매입처로부터 실물을 공급받고 수취한 정상적인 세금계산서로서 ‘사실과 다른 세금계산서’라고 볼 수 없음  [서울행정법원 2021. 4. 9. 2019구합69988]

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부가세 부과 처분 취소 소송: 사실과 다른 세금계산서 여부

본 판례는 부가가치세 부과 처분 취소 소송에 대한 서울행정법원의 판결을 정리한 것입니다. 원고는 SI(시스템 통합 및 구축) 사업 전문업체로서, 매입처로부터 받은 세금계산서가 ‘사실과 다른 세금계산서’에 해당하는지 여부가 쟁점이 되었습니다.

1. 사건 개요

1.1. 사건 정보

• 사건번호: 2019구합69988
• 사건명: 부가가치세부과처분취소
• 판결일자: 2021. 4. 9.
• 1심

1.2. 배경

원고는 2016년 BB와 ‘RRRR사업’ 관련 장비 납품 계약을 체결하고, 이와 관련하여 여러 매입처로부터 세금계산서를 수취했습니다. 그러나 과세관청은 해당 세금계산서가 ‘사실과 다른 세금계산서’에 해당한다고 판단하여 매입세액 공제를 부인하고 부가가치세를 부과했습니다.

2. 원고와 피고의 주장

2.1. 원고의 주장

원고는 이 사건 각 세금계산서가 실제 거래를 통해 수취된 정상적인 세금계산서이므로 ‘사실과 다른 세금계산서’로 볼 수 없다고 주장했습니다. 또한, 설령 그렇지 않더라도, 원고는 실질적인 계약과 납품, 대금 지급을 통해 거래가 이루어졌으며, 업계 관행상 세금계산서가 실제와 다를 수 있다는 점을 강조하며 매입세액 공제를 요구했습니다.

2.2. 피고의 주장

피고는 원고가 수취한 세금계산서가 실물 거래 없이 발급된 ‘사실과 다른 세금계산서’에 해당한다고 주장하며, 관련 매입세액을 부인하고 부가가치세 부과 처분이 적법하다고 주장했습니다.

3. 법원의 판단

3.1. 관련 법리

법원은 부가가치세법 제9조 제1항에 따라 재화의 공급은 실질적으로 얻은 이익의 유무에 관계없이 재화를 사용, 소비할 수 있는 권한을 이전하는 일체의 원인행위를 포함한다고 판시했습니다. 또한, ‘사실과 다른 세금계산서’에 해당하는지에 대한 증명 책임은 과세관청에 있다고 밝혔습니다.

3.2. 사실관계 인정

법원은 다음과 같은 사실을 인정했습니다:

• 원고와 매입처 간의 계약 체결, 납품, 대금 지급 등의 실질적인 거래 존재
• 세금계산서 발급 및 관련된 형사 사건에서의 무죄 판결 확정
• 업계의 판매 관행 및 협력업체 활용

3.3. 결론

법원은 원고가 매입처로부터 실물을 공급받고 수취한 정상적인 세금계산서이므로 ‘사실과 다른 세금계산서’에 해당한다고 보기 어렵다고 판단했습니다. 따라서, 원고의 부가가치세 부과 처분 취소 청구를 인용하고, 피고에게 소송 비용을 부담하도록 판결했습니다.

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출처 : 법제처 국가법령정보센터

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