부가가치세 경정거부처분 취소 소송 판례 정리 (서울행정법원 2021구합58370)

부가가치세경정거부처분취소  [서울행정법원 2022. 4. 15. 2021구합58370]

부가가치세 경정거부처분 취소 소송 판례 정리 (서울행정법원 2021구합58370)

1. 사건 개요

본 판례는 금융지주회사의 부가가치세 경정거부처분 취소 소송에 대한 내용을 담고 있습니다. 원고는 자회사에 대한 자금 지원으로 얻은 대여이자를 면세사업 공급가액에 포함하여 공통매입세액을 산정했습니다. 또한 자문수수료를 “전액 공제받지 못할 매입세액”으로 처리했습니다. 이에 원고는 대여이자를 면세사업 공급가액에서 제외하고, 자문수수료를 과세사업 관련 매입세액으로 보아 전액 공제를 주장하며 경정청구를 했습니다. 피고는 일부를 인용하고 나머지는 거부했고, 원고는 이에 불복하여 소송을 제기했습니다.

2. 쟁점 및 원고, 피고의 주장

2.1. 쟁점

  • 이 사건 대여이자가 비과세사업의 대가로 볼 수 있는지 여부
  • 자문수수료가 과세사업 관련 매입세액인지, 공통매입세액인지 여부

2.2. 원고의 주장

  • 이 사건 대여이자 부분: 자회사에 대한 자금 지원은 비과세사업에 해당하며, 대여이자는 비과세사업의 대가로 볼 수 없으므로 전액 공제해야 한다고 주장했습니다.
  • 자문수수료 부분: 자문수수료는 과세사업의 매입세액으로 전액 공제되어야 한다고 주장했습니다.

2.3. 피고의 주장

  • 이 사건 대여이자 부분: 대여이자는 비과세사업의 대가에 해당하므로 공통매입세액 안분계산에 포함해야 하며, 원고가 이를 입증할 자료를 제출하지 못했으므로 거부처분은 적법하다고 주장했습니다.
  • 자문수수료 부분: 자문수수료는 공통매입세액으로 보아 안분계산하는 것이 적법하다고 주장했습니다.

3. 법원의 판단

3.1. 이 사건 대여이자 부분

법원은 이 사건 대여이자가 비과세사업의 대가로 볼 수 없다고 판단했습니다.

  • 이 사건 대여이자 중 일부를 비과세사업의 대가로 분리하거나 특정할 만한 방법이 없고, 다른 안분계산방법을 적용하는 것도 불가능하다고 보았습니다.
  • 따라서 대여이자를 매입세액에서 모두 공제해야 한다고 판결했습니다.

3.2. 자문수수료 부분

법원은 자문수수료를 공통매입세액으로 보아 공통매입세액 안분계산의 방법으로 매입세액을 공제한 것은 적법하다고 판단했습니다.

4. 결론

법원은 원고의 청구 중 이 사건 대여이자 관련 부분을 인용하여, 피고의 부가가치세 경정거부처분 중 대여이자 관련 부분을 취소했습니다. 자문수수료 관련 원고의 청구는 기각했습니다. 소송 비용은 일부 원고가, 나머지는 피고가 부담하도록 판결했습니다.

5. 판결의 의미

본 판례는 금융지주회사의 부가가치세 관련 쟁점에 대해 중요한 시사점을 제공합니다. 특히, 자회사에 대한 자금 지원으로 발생하는 대여이자의 부가가치세 공제 여부에 대한 판단 기준을 제시하고 있습니다.

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출처 : 법제처 국가법령정보센터

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