법인세 부가금의 손금 산입 여부에 대한 판례 정리 (국승 서울행정법원 2020구합50249)

이 사건 부가금이 이자비용에 해당하여 수익사업의 손금으로 산입되는지 여부  [서울행정법원 2021. 1. 26. 2020구합50249]

판결의 요지

이 사건 부가금은 원고가 고유목적사업인 급여사업에 지출한 것으로, 수익사업의 소득을 얻기 위해 지출한 비용으로 볼 수 없으므로, 수익사업의 손금에 산입될 수 없다.

1. 사건의 배경

원고는 비영리내국법인으로, 회원들의 생활 안정과 복지 증진을 위해 급여, 대여, 복리후생 사업 등을 영위한다. 원고는 회원들로부터 부담금을 받아 주식, 채권 등에 투자하고, 회원에게 퇴직 시 부가금을 포함한 퇴직급여를 지급한다. 원고는 2012 사업연도 법인세 신고 시 부가금을 고유목적사업준비금으로 적립하고, 일부를 손금 산입하여 소득금액을 산정했다. 이후, 원고는 부가금 전부를 수익사업의 손금으로 산입해야 한다고 주장하며 경정청구를 했으나 거부당했다. 이에 불복하여 소송을 제기했다.

2. 원고의 주장

1. 주위적 주장: 부가금은 부담금 납입에 대한 대가로 지급되는 이자비용이므로 수익사업의 손금으로 산입되어야 한다. 부가금이 고유목적사업인 퇴직급여로 지급되더라도, 부담금 운용수익에 대응하는 비용이므로 수익사업의 손금에 해당한다.
2. 예비적 주장: 급여사업은 보험적 성격의 공제업으로 보아야 하는데, 부가금은 금융상품의 이자와 유사하므로 수익사업의 손금에 해당한다. 그렇지 않다면, 부담금 운용수익을 수익사업이 아닌 기금조성사업의 수익으로 보아 과세대상에서 제외해야 한다.

3. 관련 법령

• 법인세법 제3조: 비영리법인의 과세소득 범위 규정 (수익사업 소득, 토지 등 양도소득)
• 법인세법 제29조: 고유목적사업준비금의 손금 산입 규정
• 법인세법 제113조: 수익사업과 그 외 사업의 구분 경리 의무 규정
• 법인세법 시행령 제2조: 수익사업의 정의